Eseguirò rna seq, analisi dge, wgcna e trascrittomica

Offro analisi di transcriptomics rigorose, pronte per la pubblicazione, dal conteggio grezzo alla interpretazione biologica usando DESeq2, WGCNA e strumenti di arricchimento di pathway in R e Python.

Offro:

• Analisi di espressione differenziale: DESeq2, limma, edgeR
• WGCNA: costruzione di reti di co-espressione, identificazione di geni hub, correlazione con tratti
• Arricchimento di pathway: GO, KEGG, Reactome usando clusterProfiler
• ssGSEA: infiltrazione di cellule immunitarie e scoring di set di geni
• Gestione di dataset GEO: recupero dati, preprocessing, normalizzazione
• Visualizzazione: volcano plot, heatmap, PCA, pheatmap, ggplot2
• Integrazione con pipeline di scoperta di farmaci o farmacologia di rete

Competenze:

• R · DESeq2 · WGCNA · limma · clusterProfiler · ggplot2 · pheatmap
• Python · Pandas · matplotlib · seaborn
• GEO · TCGA · KEGG · Reactome · GO

Perché scegliermi:

• Esperienza pratica con dataset di transcriptomics di COPD e cancro reali
• Script R puliti e annotati consegnati con ogni ordine
• Figure formattate secondo gli standard di pubblicazione
• Risposta rapida e attenzione ai dettagli durante tutto il progetto
• Gestione confortevole di dataset GEO complessi e reali