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Eseguirò transcriptomics e modellazione qsar
Ricercatore in biologia computazionale e bioinformatica | Multi omics | Python, R
Esperto di bioinformatica specializzato in scripting Python, R e Bash, con forte enfasi su soluzioni computazionali basate sulla ricerca. La mia esperienza include machine learning, integrazione multi...
Informazioni su questo servizio
Offro analisi di transcriptomics rigorose, pronte per la pubblicazione, dal conteggio grezzo alla interpretazione biologica usando DESeq2, WGCNA e strumenti di arricchimento di pathway in R e Python.
Offro:
- Analisi di espressione differenziale: DESeq2, limma, edgeR
- WGCNA: costruzione di reti di co-espressione, identificazione di geni hub, correlazione con tratti
- Arricchimento di pathway: GO, KEGG, Reactome usando clusterProfiler
- ssGSEA: infiltrazione di cellule immunitarie e scoring di set di geni
- Gestione di dataset GEO: recupero dati, preprocessing, normalizzazione
- Visualizzazione: volcano plot, heatmap, PCA, pheatmap, ggplot2
- Integrazione con pipeline di scoperta di farmaci o farmacologia di rete
Competenze:
- R · DESeq2 · WGCNA · limma · clusterProfiler · ggplot2 · pheatmap
- Python · Pandas · matplotlib · seaborn
- GEO · TCGA · KEGG · Reactome · GO
Perché scegliermi:
- Esperienza pratica con dataset di transcriptomics di COPD e cancro reali
- Script R puliti e annotati consegnati con ogni ordine
- Figure formattate secondo gli standard di pubblicazione
- Risposta rapida e attenzione ai dettagli durante tutto il progetto
- Gestione confortevole di dataset GEO complessi e reali
Tecnologia:
Excel
•
Fogli Google
•
Quaderno jupyter
•
Pandas
•
RStudio
Expertise:
Statistiche
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Non ho uno script specifico in mente, solo un problema. Puoi comunque aiutarmi?
Sì — scrivimi con i tuoi dati e cosa stai cercando di capire, e ti suggerirò l'approccio giusto prima che tu faccia l'ordine. Non è necessario conoscere i dettagli tecnici da solo.
Mantieni i miei dati e le ricerche riservati?
Sì. I tuoi dati, l'idea di ricerca e i risultati non vengono mai condivisi, riutilizzati o discussi con nessuno. Rimane tutto strettamente tra noi.
Non sono molto esperto di coding — capirò lo script finale?
Sì. Scrivo codice pulito, commentato e spiego i risultati in modo semplice, non solo con gergo tecnico. Capirai cosa fa lo script e perché.
Puoi lavorare con il mio dataset/database specifico (GEO, ChEMBL, PDB, NCBI, ecc.)?
Sì, lavoro regolarmente con tutti i principali database biologici. Basta menzionarlo nel messaggio e ti confermerò se posso gestirlo.
Hai bisogno del mio dataset completo prima di ordinare, o posso inviarlo dopo?
Entrambe le opzioni vanno bene. Se mi scrivi prima con un esempio o una descrizione dei tuoi dati, posso confermare portata e tempistiche prima di effettuare l'ordine — così eviti sorprese.
Questo è solo per studenti, o lavori anche con ricercatori e aziende?
Lavoro con chiunque — studenti, ricercatori PhD, professori e aziende. La portata e i pacchetti di prezzo si adattano alla complessità del tuo progetto.
