Eseguirò l'espressione differenziale e l'arricchimento in r

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Stati Uniti

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Bioinformatica e analisi dei dati di sequenziamento

Sono uno studente di dottorato in Medical Informatics con background in Medicina Clinica e ricerca bioinformatica pubblicata. Elaboro dati bulk RNA-seq, dati FASTQ di singola cellula usando Cell Range...
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Bioinformatic downstream analysis professionale e visualizzazione di qualità pubblicazione in R. Mi occupo di matrici di conteggio dell’espressione genica grezze, tabelle microarray o elenchi DEG già calcolati per eseguire test statistici rigorosi e creare figure pronte per la pubblicazione per riviste di alto impatto. Pacchetti e prezzi: - Base (10$ / 2 giorni): 1 confronto DEG analysis (DESeq2/limma/edgeR). Include Volcano plot (EnhancedVolcano), grafico PCA delle campioni, heatmap dei top DEG (pheatmap), tabelle riepilogative e script R riproducibile. - Standard (20$ / 4 giorni): 1 confronto DEG + Functional Enrichment. Tutti i deliverables Base più analisi di arricchimento GO (BP/MF/CC) e KEGG tramite clusterProfiler. Dotplots, barplots e cnetplots inclusi. - Premium (40$ / 7 giorni): fino a 2 confronti DEG + GO, KEGG e GSEA enrichment. Figure di pubblicazione altamente personalizzate (PDF vettoriale e PNG a 600 DPI) con palette di colori, annotazioni geniche e script R completamente commentato. Requisiti d’input: Matrice di conteggio grezzo o tabella di espressione normalizzata con foglio di metadati campione corrispondente (gruppi e covariate). Ambito di lavoro: Solo analisi downstream; uso ricercato. Incluso rapida consegna e riassunto in inglese chiaro.