Elaborerò dati bulk rna seq fastq e eseguirò analisi di espressione differenziale

Alcune informazioni sono state tradotte automaticamente.

Stati Uniti

Parlo Cinese, Inglese

Bioinformatica e analisi dei dati di sequenziamento

Sono uno studente di dottorato in Medical Informatics con background in Medicina Clinica e ricerca bioinformatica pubblicata. Elaboro dati bulk RNA-seq, dati FASTQ di singola cellula usando Cell Range...
Informazioni su questo servizio

Elaborazione di Bulk RNA-seq: 8 USD per campione.

Prezzo in base al volume per ordine: 1-5 campioni 8 USD ciascuno; 6-19 7,20 USD; 20-49 6,40 USD; 50-99 5,60 USD; oltre 100 4,80 USD. Lo sconto più alto applicabile si applica a tutti i campioni; non cumulabile.

Pacchetti: 5 campioni 40 USD; 25 campioni 160 USD; 50 campioni 280 USD. Contattami per altre quantità e un'offerta personalizzata. Le tasse/commissioni di Fiverr sono separate.

Workflow: FastQC/fastp, HISAT2, featureCounts, più un contrasto DESeq2, PCA, volcano/heatmap e GO o GSEA quando il disegno dello studio lo supporta. Un singolo campione supporta solo l'elaborazione a monte; l'analisi differenziale richiede replicati biologici.

Umano, topo o ratto; riferimento adeguato richiesto. Fino a 30 milioni di read pairs per campione. Stesso riferimento e workflow concordato per ogni ordine. Consegne: QC, tabelle, script/parametri, README in inglese con metodi e una revisione scope-fix.

Invia il conteggio dei campioni, il tipo di saggio, la profondità, i gruppi e il riferimento prima di ordinare. Contrasti extra, riferimenti speciali e dati più approfonditi richiedono uno scope separato. Trasferimento dati autorizzato solo. Solo elaborazione; nessun servizio di download standalone. Uso per ricerca; nessuna interpretazione clinica o garanzia di significato.

Linguaggio di programmazione:

R

Tecnologia:

Altro

Tipo di analisi:

Analisi quantitativa

•

analisi statistica

Expertise:

Statistiche

•

Verifica delle ipotesi

Strumenti:

RStudio