Elaborerò dati bulk rna seq fastq e eseguirò analisi di espressione differenziale
Bioinformatica e analisi dei dati di sequenziamento
Informazioni su questo servizio
Elaborazione di Bulk RNA-seq: 8 USD per campione.
Prezzo in base al volume per ordine: 1-5 campioni 8 USD ciascuno; 6-19 7,20 USD; 20-49 6,40 USD; 50-99 5,60 USD; oltre 100 4,80 USD. Lo sconto più alto applicabile si applica a tutti i campioni; non cumulabile.
Pacchetti: 5 campioni 40 USD; 25 campioni 160 USD; 50 campioni 280 USD. Contattami per altre quantità e un'offerta personalizzata. Le tasse/commissioni di Fiverr sono separate.
Workflow: FastQC/fastp, HISAT2, featureCounts, più un contrasto DESeq2, PCA, volcano/heatmap e GO o GSEA quando il disegno dello studio lo supporta. Un singolo campione supporta solo l'elaborazione a monte; l'analisi differenziale richiede replicati biologici.
Umano, topo o ratto; riferimento adeguato richiesto. Fino a 30 milioni di read pairs per campione. Stesso riferimento e workflow concordato per ogni ordine. Consegne: QC, tabelle, script/parametri, README in inglese con metodi e una revisione scope-fix.
Invia il conteggio dei campioni, il tipo di saggio, la profondità, i gruppi e il riferimento prima di ordinare. Contrasti extra, riferimenti speciali e dati più approfonditi richiedono uno scope separato. Trasferimento dati autorizzato solo. Solo elaborazione; nessun servizio di download standalone. Uso per ricerca; nessuna interpretazione clinica o garanzia di significato.
Linguaggio di programmazione:
R
Tecnologia:
Altro
Tipo di analisi:
Analisi quantitativa
•
analisi statistica
Expertise:
Statistiche
•
Verifica delle ipotesi
Strumenti:
RStudio
FAQ
Traduzione automatica.
Cosa devo inviare prima di ordinare?
Inviami organismo, saggio, numero di campioni, numero di read-pair, build di riferimento e metadati del campione con gruppi e contrasti. Tutti i pacchetti accettano FASTQ. L'analisi differenziale richiede un disegno di studio adeguato e replicati biologici. Concorda su un metodo autorizzato e sicuro per il trasferimento dei dati prima di effettuare l'ordine.
