Sarò il tuo consulente esperto di bioinformatica per la tua ricerca

Per docking: la struttura della tua proteina e il ligando (PDB, SDF...). Per MD: il sistema che vuoi simulare e i parametri di simulazione necessari (forcefield, durata, ensemble). Per transcriptomics: la tua matrice di conteggio o i numeri di accesso GEO e il progetto sperimentale. Mi occuperò del resto.

Assolutamente! Ho accesso a un'infrastruttura GPU ad alte prestazioni per simulazioni impegnative dal punto di vista computazionale. Sistemi grandi, tempi lunghi e complessi multi-chain sono tutti gestibili — discutiamo delle dimensioni del tuo sistema prima di ordinare così possiamo concordare tempi di consegna realistici.

Sì, posso configurare simulazioni MD secondo le tue esigenze, fino a oltre 500 ns. Le simulazioni più lunghe potrebbero richiedere più tempo e risorse, cosa di cui possiamo discutere in anticipo.

Certamente! Fornisco analisi dettagliate post-simulazione e output grafici per supportare i tuoi obiettivi di ricerca.

Sì. Lavoro sia con dati RNA-seq che microarray – analisi di espressione differenziale (DESeq2, edgeR, limma-voom); WGCNA; arricchimento di gene ontology e pathway; e infiltrazione immunitaria. Se hai conteggi grezzi, matrici normalizzate o numeri di accesso GEO, posso lavorare con qualsiasi di questi.

Sì. Eseguo pipeline di machine learning di consenso combinando Random Forest, regressione LASSO e SVM-RFE per identificare e classificare i potenziali biomarcatori, seguiti da validazione cross-cohort quando i dataset sono disponibili. I risultati includono grafici di importanza delle feature e curve ROC adatti alla pubblicazione.

Sì! Sono specializzato in figure ad alta risoluzione pronte per la pubblicazione e illustrazioni scientifiche su misura secondo le linee guida delle riviste. Conosco BioRender, strumenti Adobe e Canva. Produco figure in formati adatti alla sottomissione su rivista.

A seconda della complessità e del mio programma, offro opzioni di consegna rapida a un costo aggiuntivo. Contattami prima di ordinare se hai una scadenza rigida.

100% sì. Mantengo la massima riservatezza. Non condivido dati dei clienti o dettagli del progetto, e sono disponibile a firmare un NDA se il tuo lavoro lo richiede.

Assolutamente! Posso spiegare i risultati e il workflow in modo semplice, rendendolo comprensibile. Se sei un ricercatore di laboratorio umido o uno studente alle prime armi con la parte computazionale, posso adattare il livello di spiegazione di conseguenza.