Farò metagenomica, trascrittomica, epigenetica, analisi di dati singlecell per te

Metagenomica, Bulk-RNA & Single-cell RNA Seq, e qualsiasi tipo di analisi di dati genomici e bioinformatica sono inclusi in questo servizio.

Se hai dati genomici di qualsiasi piattaforma (Short read & Long read) che devono essere analizzati, ottenere approfondimenti e visualizzazioni con interpretazioni, sei nel posto giusto.

Sono un bioinformatico di formazione e uno scienziato bioinformatico di professione.

Lavoro con ricercatori, accademici, team di sanità pubblica e biotech su bioinformatica, metagenomica (sequenziamento dell'intero genoma, 16S), trascrittomica, biologia del cancro, epidemiologia, malattie infettive e progetti GWAS.

Sarei felice di offrire i seguenti servizi:

Analisi di base e approfondita: QC dei dati, mappatura e allineamento, filogenesi, assemblaggio e annotazione, classificazione tassonomica, analisi statistica (espressioni differenziali, diversità alpha-beta, analisi di sintonizzazione, chiamata di varianti)

Visualizzazioni pronte per pubblicazioni: Volcano plots, PCoA, UMAP, alberi filogenetici, grafici, heatmap, circo plot

Cosa mi serve da te:

Accetto FASTQ o FASTQ.GZ, BAM, VCF, matrici di conteggio e numeri di accesso GEO o SRA da Illumina, Nanopore o qualsiasi piattaforma