Farò analisi bioinformatiche, ngs, rnaseq e trascrittoma

Ciao, sono Shohel Islam, un bioinformatico e biotecnologo. Mi occuperò di WGS, RNA-seq, 16s rRNA-seq, ncRNA-seq (miRNA, lncRNA) e analisi di dati Microarray in Linux terminal e RStudio. Se hai difficoltà a capire progetti legati a NGS, sono qui per aiutarti. Ho lavorato su diversi articoli di ricerca e so che tipo di dati sono necessari.

Esempi di miei articoli di ricerca:

1. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317008
2. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319952
3. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319176
4. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0309353
5. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0298543

Puoi usufruire dei miei servizi in:

• Recupero dati dal database SRA / Letture raw personalizzate di RNA-Seq
• Controllo qualità delle letture raw (Fastqc)
• Taglio delle letture di scarsa qualità e degli adattatori
• Allineamento delle letture raw
• Generazione della matrice di conteggio delle feature
• Normalizzazione dei dati (RPKM/FPKM/TPM)
• Analisi differenziale dei geni
• Elenco di geni regolati in su e in giù
• Previsione di RNA non codificante
• Chiamata di varianti e sua annotazione
• Analisi di spatial transcriptomics

Scrivimi prima per confermare che sono disponibile nel tuo orario e che posso fare ciò di cui hai bisogno. Grazie!