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Costruirò strumenti bioinformatici personalizzati in python
Sviluppatore di bioinformatics e ETL
Mi specializzo in pipeline di dati bioinformatics e architetture ETL, con una solida base nello sviluppo Python. Recentemente, ho costruito e distribuito sei applicazioni di bio-data in soli 17 giorni...
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno di analizzare sequenze di dati biologici, mutazioni o strutture proteiche ma non vuoi passare settimane a scrivere script da zero? Creo strumenti bioinformatici in Python che fanno l'analisi e ti forniscono output puliti e utilizzabili.
Ciò che ho creato: un simulatore di editing genetico CRISPR (857 siti PAM analizzati sul gene HBB), un tracker di mutazioni di varianti COVID (Omicron BA.3.2, 91 mutazioni identificate), un analizzatore di strutture proteiche (testato con sickle cell E6V e BRCA1 C61G), e un esploratore di interazioni tra farmaci e target (Imatinib mappato su 45 target).
Portfolio: github.com/CodeXSourabhsingh
Il mio stack: Python, Biopython, Pandas, NumPy, MySQL, Streamlit, Py3Dmol, NCBI Entrez, RCSB PDB, ChEMBL.
Cosa ottieni:
- Codice funzionante, non pseudocodice
- Dati reali da database pubblici, non esempi di fantasia
- Struttura pulita, documentata
- 30 giorni di correzioni di bug
Inviami una breve descrizione dei dati biologici che hai, quale domanda vuoi rispondere, quale output ti serve. Risponderò entro 24 ore con un preventivo e una timeline.
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Tecnologia:
Python
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Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Con che tipo di dati biologici puoi lavorare?
Sequenze DNA/RNA (FASTA), strutture proteiche (PDB), tabelle di espressione genica (CSV), dati di varianti (VCF), e qualsiasi database bio pubblico tramite API.
Fornisci i dati?
No. Tu fornisci i dati o la domanda biologica. Io recupero dai fonti pubbliche se necessario — NCBI, PDB, ChEMBL.
Puoi costruire uno strumento per il mio organismo specifico?
Sì, purché esistano dati di riferimento. Gli strumenti universali sono il mio punto forte — stesso motore, qualsiasi organismo.
Come posso sapere se lo strumento funziona?
Ti invio una registrazione dello schermo mentre funziona con dati reali. Puoi testarlo prima della consegna finale.
Cosa rende il tuo lavoro diverso dagli altri sviluppatori?
Ho consegnato 5 applicazioni di bio-data in 17 giorni. I miei strumenti funzionano con dati reali di NCBI, ChEMBL e PDB — e uno è stato validato pubblicamente dal CEO di una società di eClinical basata su AI.
