Eseguirò analisi bioinformatiche e allineamento di sequenze
Analista statistico, analisi dati di tesi e scrittura di ricerche
Informazioni su questo servizio
Benvenuto nel mio servizio professionale di analisi di bioinformatica e dati molecolari. Fornisco elaborazioni accurate di sequenze, costruzione di alberi evolutivi e metriche di diversità genetica per ricercatori e biologi.
Utilizzando strumenti computazionali standard del settore, estrarrò intuizioni biologiche significative dai tuoi dataset di nucleotide o proteine.
Ciò che offro:
Allineamento di sequenze (MSA): Modifica dettagliata, pulizia e allineamento di sequenze usando BioEdit, ClustalW o MUSCLE.
Analisi filogenetica: Costruzione avanzata di alberi evolutivi con software MEGA (Massima Verosimiglianza, Neighbor-Joining) con supporto robusto di bootstrap.
Diversità genetica: Calcolo di polimorfismi del DNA, diversità di haplotipi e metriche di varianza genetica usando DnaSP.
Query su database: Ricerca NCBI BLAST e raccolta di sequenze.
Esportazioni pronte: Formattazione e rendering di alta qualità di alberi e file di allineamento (.fasta, .meg, .nwk).
Strumenti che utilizzo:
MEGA, BioEdit e DnaSP
Database & strumenti web NCBI
R / RStudio (per grafici analitici personalizzati)
Ti prego di inviarmi un messaggio prima di ordinare, così possiamo discutere i tuoi formati di dati specifici e gli obiettivi del progetto!
FAQ
Traduzione automatica.
Quali formati di file accetti per l'allineamento di sequenze?
Accetto formati di file standard di biologia molecolare, tra cui FASTA, GenBank (.gb), MEGA (.meg) e phylip (.phy), così come testi di sequenze grezze non formattati.
Quali metodi di alberi filogenetici puoi eseguire in MEGA?
Posso costruire alberi usando i metodi di Massima Verosimiglianza (ML), Neighbor-Joining (NJ), Minima Evoluzione (ME) e UPGMA, con supporto di bootstrap personalizzato.
Puoi calcolare la diversità di haplotipi o i siti polimorfici?
Usando DnaSP, posso analizzare dati di genetica delle popolazioni per determinare il numero di siti polimorfici, diversità di haplotipi (Hd), diversità di nucleotide (π) e varianza di sequenza.

