Eseguirò analisi bioinformatiche e allineamento di sequenze
Analista statistico, analisi dati di tesi e scrittura di ricerche
Informazioni su questo servizio
Benvenuto nel mio servizio professionale di analisi di bioinformatica e dati molecolari. Fornisco elaborazioni accurate di sequenze, costruzione di alberi evolutivi e metriche di diversità genetica per ricercatori e biologi.
Utilizzando strumenti computazionali standard del settore, estrarrò intuizioni biologiche significative dai tuoi dataset di nucleotide o proteine.
Ciò che offro:
Allineamento di sequenze (MSA): Modifica dettagliata, pulizia e allineamento di sequenze usando BioEdit, ClustalW o MUSCLE.
Analisi filogenetica: Costruzione avanzata di alberi evolutivi con software MEGA (Massima Verosimiglianza, Neighbor-Joining) con supporto robusto di bootstrap.
Diversità genetica: Calcolo di polimorfismi del DNA, diversità di haplotipi e metriche di varianza genetica usando DnaSP.
Query su database: Ricerca NCBI BLAST e raccolta di sequenze.
Esportazioni pronte: Formattazione e rendering di alta qualità di alberi e file di allineamento (.fasta, .meg, .nwk).
Strumenti che utilizzo:
MEGA, BioEdit e DnaSP
Database & strumenti web NCBI
R / RStudio (per grafici analitici personalizzati)
Ti prego di inviarmi un messaggio prima di ordinare, così possiamo discutere i tuoi formati di dati specifici e gli obiettivi del progetto!
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FAQ
Traduzione automatica.
Quali formati di file accetti per l'allineamento di sequenze?
Accetto formati di file standard di biologia molecolare, tra cui FASTA, GenBank (.gb), MEGA (.meg) e phylip (.phy), così come testi di sequenze grezze non formattati.
Quali metodi di alberi filogenetici puoi eseguire in MEGA?
Posso costruire alberi usando i metodi di Massima Verosimiglianza (ML), Neighbor-Joining (NJ), Minima Evoluzione (ME) e UPGMA, con supporto di bootstrap personalizzato.
Puoi calcolare la diversità di haplotipi o i siti polimorfici?
Usando DnaSP, posso analizzare dati di genetica delle popolazioni per determinare il numero di siti polimorfici, diversità di haplotipi (Hd), diversità di nucleotide (π) e varianza di sequenza.

