eseguirò simulazioni di dinamica molecolare 100ns 33 analisi gromacs

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Biotecnologo, Bioinformatica CADD e Ricerca Scientifica, Ricerca IP

Supportiamo la ricerca nel campo delle scienze della vita attraverso servizi di drug discovery computazionale e bioinformatica. BTGenZ è specializzata in docking molecolare, simulazioni di dinamica mo...
Informazioni su questo servizio

Utilizzando GROMACS, fornisco simulazioni e una suite completa di analisi 33, soggetta alla compatibilità del sistema.


Ciò che ottieni:

  • Stabilità strutturale: RMSD, RMSF, raggio di gyration (Rg), SASA e DSSP.
  • Interazioni molecolari: Legami idrogeno, ponti salini, contatti idrofobici, fingerprint ProLIF, analisi di distanza, angolo e dihedral.
  • Energia di binding: MM-PBSA e MM-GBSA.
  • Analisi avanzate: PCA, DCCM, clustering della traiettoria, landscape di energia libera (FEL) e analisi di Ramachandran.
  • Analisi aggiuntive: QC, centratura PBC, dinamiche di idratazione, RDF, MSD, densità spaziale, dinamiche delle tasche, area di interfaccia, descrittori di forma e strutture rappresentative, più analisi specializzate applicabili.
  • Output: File di simulazione grezzi, dati numerici, grafici di analisi e strutture/traiettorie processate dove applicabile.


Rapporto HTML interattivo: $300 in più. Vedi un esempio: https://sujay-19m.github.io/BTGenZ-Molecular-Dynamics-Scientific-Report/


Hai bisogno di simulazioni più lunghe, docking molecolare, QSAR o servizi CADD integrati? Contattami per prezzi personalizzati prima di ordinare.

Dominio:

Altro

Expertise:

Altro

Linguaggio di programmazione:

Python

Strumenti:

Altro

Tecnologia:

Altro

Modelli e metodi:

Altro

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