Farò variant calling genomico e annotazione dei geni usando gatk

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Ali Naqvi

Pakistan

Parlo Urdu, Inglese

Specialista in Bioinformatica e AI Biomedica

Sono uno specialista in Bioinformatica & AI Biomedica che fornisce risultati di ricerca accurati e riproducibili. - Analisi NGS, RNA-seq & WGS - Single-cell RNA-seq — clustering, UMAP, traiettoria - ...
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Informazioni su questo servizio

Hai dati di sequenza genomica e hai bisogno di aiuto con l'identificazione delle varianti o l'annotazione dei geni? Eseguirò un'analisi genomica chiara, ben documentata e consegnerò risultati che puoi usare direttamente nella tua ricerca o tesi.


Ciò che offro:

  • Controllo qualità e trimming della sequenza DNA (FastQC, Trimmomatic)
  • Allineamento al genoma di riferimento (BWA, Bowtie2)
  • Variant calling di SNP e indel (GATK, bcftools)
  • Annotazione e filtraggio delle varianti (SnpEff, ANNOVAR)
  • Ricerca dei geni e annotazione funzionale (Prokka, BLAST)
  • Grafici Manhattan, tabelle riassuntive delle varianti e rapporto scritto


Tutti gli script (Python/Bash/R) sono inclusi, così la tua analisi è completamente riproducibile. Lavoro con genomi umani, vegetali e microbici.


Contattami con i tuoi file FASTQ o VCF e i dettagli dell'organismo prima di ordinare.

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do genomics variant calling and gene annotation using gatk
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do genomics variant calling and gene annotation using gatk