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Ricercatore laureato
Posso eseguire simulazioni di dinamica molecolare per le tue esigenze di ricerca. Coprirò tutte le impostazioni di base della simulazione, l'esecuzione e l'analisi.
Posso eseguire simulazioni gromacs/htmd con una struttura proteica fornita, dove puoi anche specificare forcefield/altri parametri. Dopo le fasi di equilibration e produzione, verrà effettuata l'analisi della simulazione di RMSD, RMSF e Rg. Ti prego di specificare se hai bisogno di analisi del ligando, come mmgbsa/pbsa e/o analisi della formazione di legami.
Verranno anche generate figure usando R ggplot secondo le tue esigenze. La simulazione finale e l'analisi ti saranno restituite tutte.