Farò simulazioni di dinamica molecolare, progettazione di percorsi, dft, qsar

Ti aiuterò con la scoperta di farmaci in silico usando strumenti standard del settore come GROMACS, ORCA, AutoDock, Schrödinger e cheminformatica basata su Python.

Questo servizio include:

Docking molecolare (Proteina-Ligando) usando Glide/MOE/AutoDock

Simulazione MD in GROMACS e 100 ns di un complesso in circa ~6 ore (GROMACS fino a 5000 ns)

• RMSD
• RMSF
• SASA
• RG
• H-Bond
• DCCM
• PSA
• PCA
• DSSP
• FEL

Modellazione QSAR

• 2D/3D
• regressione IC50/pIC50
• Ottimizzazione dei descrittori

Calcoli DFT:

• Gap HOMO-LUMO, grafici degli orbitali, mappe ESP
• Ottimizzazione della geometria, frequenze IR
• UV/Vis (TD-DFT), fluorescenza

Modellazione farmacoforo e screening virtuale

Calcolo dell'energia di binding

• MM-GBSA
• MM-PBSA

Visualizzazione 3D/2D delle interazioni di binding di Proteina-Ligando

Opzionale:

• Metodo
• Sezione Risultati e Discussione per pubblicazione/tesi

Riceverai:

• file .pdb/.xyz/.csv
• analisi scritta
• schede di punteggio + grafici
• immagini di 300/500/600dpi delle interazioni

Che tu sia uno studente di PhD/MS, ricercatore accademico o scienziato industriale, fornisco risultati rapidi, precisi e con visualizzazioni di qualità pubblicabile.

Prima di ordinare, inviami un messaggio per assicurarti che i tuoi target e ligandi siano compatibili con gli strumenti