Elaborerò e analizzerò i tuoi dati genomici o vcf usando python

Hai dati genomici che necessitano di elaborazione, filtraggio o 

annotazione ma non sai da dove iniziare?

Costruirò una pipeline bioinformatica affidabile per elaborare i tuoi 

dati VCF, BCF o GWAS usando strumenti standard del settore, fornendo 

risultati puliti, annotati e pronti per l'analisi.

Le cose che posso fare:

Elaborazione e conversione di formati di file VCF/BCF

Filtraggio delle varianti per qualità, profondità e frequenza degli alleli

Annotazione SNP usando Ensembl VEP

Elaborazione dei dati GWAS con PLINK

Statistiche QC e report di riepilogo con bcftools

Conversione di formati di file (VCF, BCF, PLINK, haps/sample)

Automazione di workflow completi con Python

Visualizzazione dei dati delle varianti e delle metriche di qualità

Cosa riceverai:

File di output elaborati e filtrati

Rapporto riepilogativo QC

Script di pipeline Python (pulito, commentato, riutilizzabile)

Documentazione chiara e istruzioni d'uso

Lavoro con bcftools, tabix, PLINK, Ensembl VEP e Python 

gli stessi strumenti usati nelle pipeline di ricerca GWAS e genomica in produzione.

Contattami prima di ordinare per descrivere il tuo dataset e i tuoi obiettivi.