Farò modellazione di omologia, docking molecolare e simulazioni MD

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Bioinformatica strutturale

Dottorando specializzato in bioinformatica strutturale e scoperta di farmaci guidata dall'AI. Posso fornire soluzioni di ricerca pronte per la pubblicazione utilizzando protocolli standard del settore...
Informazioni su questo servizio

Accelera la tua ricerca con servizi professionali di scoperta di farmaci computazionale. Come dottorando in Structural Bioinformatics, offro simulazioni e analisi rigorose, pronte per la pubblicazione, personalizzate per i tuoi specifici target biologici.

Ciò che offro:

  1. Consulenza: Discussione sulle possibili strategie per risolvere i compiti.
  2. Metodologia dettagliata: Dettagli su input, metodi e strumenti.
  3. Homology Modeling: Predizione di strutture 3D di alta qualità (AlphaFold2/Modeller) con validazione (Ramachandran, ERRAT, Verify3D).
  4. Docking molecolare: Docking completo di proteina-ligando, proteina-proteina e proteina-DNA usando AutoDock Vina, MoleDock o HADDOCK.
  5. Simulazioni MD (GROMACS): Simulazioni avanzate di complessi. Fornisco grafici RMSD, RMSF, raggio di gyration, stabilità dei legami H e SASA.
  6. Energia di binding: Calcoli di affinità precisi usando metodi MMPBSA/GBSA.
  7. QSAR & ML: Modelli di Machine Learning per prevedere attività e tossicità dei composti.

Perché lavorare con me? Non mi limito a far funzionare software; produco soluzioni per critici complessi di bioinformatica.

Riceverai:

  • Immagini di visualizzazione 3D ad alta risoluzione.
  • Grafici e tabelle di dati di qualità pubblicabile.
  • Rapporti dettagliati sulla metodologia per i tuoi manoscritti.

Dominio:

Machine Learning

Altro

Expertise:

Analisi predittiva

Linguaggio di programmazione:

Python

Strumenti:

Quaderno jupyter

Excel

Altro

Tecnologia:

Python

Colab

Excel

Altro

Modelli e metodi:

Machine Learning

Apprendimento supervisionato