Eseguirò analisi bioinformatica di rna seq e consegnerò un rapporto chiaro

Offro analisi bioinformatica chiare e riproducibili per progetti di RNA-seq e transcriptomics.

Il pacchetto Basic è pensato per dati di RNA-seq processati, come matrice di conteggio, tabella di espressione, annotazione dei trascritti o altri file pronti per l'analisi. Copre fino a 12 campioni e un confronto definito.

In base ai tuoi dati e alla tua domanda di ricerca, l'analisi può includere:

-Controllo, filtraggio e normalizzazione dei dati

-PCA e clustering dei campioni

-Analisi differenziale di espressione genica

- Tabelle DEG e riepiloghi di espressione

-Heatmap, grafici a volcano e altre visualizzazioni

-Analisi a livello di trascritti o isoform per dataset adatti

-Script riproducibili in R o Python

-Un riassunto conciso dei metodi e dei risultati principali

Le consegne possono includere tabelle processate, figure, script e un riepilogo dei risultati.

Contattami prima di ordinare. Invia il tuo organismo, numero di campioni, gruppi sperimentali, tipi di file disponibili e domanda di ricerca principale.

Il processamento di FASTQ raw, più di 12 campioni, confronti multipli, disegni complessi, scoperta di isoform a lunga lettura e arricchimento funzionale non sono inclusi nel pacchetto Basic. Questi possono essere discussi come progetto personalizzato.