Eseguirò docking e simulazioni di dinamica molecolare

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Usman Shahid
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Ciao Fiverr, sono Usman. Biologo computazionale che lavora nel campo della scoperta di farmaci, inibizione delle proteine e molti altri settori. Ho aiutato studenti di PhD e MPhil a completare le loro ricerche.

  1. Docking Starter: Docking di 1-2 ligandi con proteina target + visualizzazione dell'affinità di binding e della posa. Analisi ADMET.
  2. Binding Insight: 5-10 ligandi, analisi delle interazioni, mappatura dei siti di binding e confronto dei punteggi di docking. Analisi ADMET.
  3. Dynamic Discovery Suite: Docking completo + simulazioni MD (da 10 a 100 ns) con grafici di RMSD, RMSF, Rg e stabilità del binding. (Parliamone se hai bisogno di più tempo di simulazione.)
  4. Altri servizi sono disponibili per rendere la tua ricerca più efficace, come MMPBSA, MMGBSA, analisi H-bond, ecc.
  5. Se vuoi discutere di progetti di ricerca, sono anche disponibili.

  • Strumento

    • Python

  • Tipo di grafico

    • Confronto
    • Distribuzione
    • Motivi

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Usman Shahid

molecular docking, Molecular dynamic simulations

  • DaPakistan
  • Membro dadic 2022
  • Tempo di risposta medio1 ora

  • Lingue

    Inglese
I am a computational biology researcher specializing in structure-based drug discovery and molecular docking. I use AutoDock Vina and PyMOL to perform end-to-end virtual screening pipelines — from target protein preparation to ligand docking, interaction analysis, and drug-likeness evaluation using Lipinski and Veber filters. What you get: Target protein preparation from PDB Molecular docking using AutoDock Vina Virtual screening of compound libraries ADMET & drug-likeness evaluation 10-100ns simulations in AMBER Clean report with results and binding scores.

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