Analizzerò scrna seq, spatial transcriptomics e dati ngs

Ottieni analisi dei dati NGS di qualità pubblicazione da un bioinformatico esperto

Sono specializzato in analisi di dati di Next-Generation Sequencing (NGS), con esperienza pratica nel consegnare risultati per pubblicazioni peer-reviewed. Trasformo dati di sequenziamento grezzi in intuizioni biologiche chiare e pronte per la pubblicazione, supportate da una solida conoscenza del dominio in biologia sperimentale.

Servizi che offro:

• Analisi scRNA-Seq: pipeline end-to-end, controllo qualità, riduzione della dimensionalità (PCA/UMAP), clustering, annotazione dei tipi cellulari e inferenza delle traiettorie (Seurat/Bioconductor)
• Spatial Transcriptomics: integrazione con dati scRNA-seq, mappatura dell'espressione genica sulla morfologia dei tessuti, identificazione spaziale dei geni
• Bulk RNA-Seq: FastQC, allineamento, analisi di espressione differenziale (DESeq2), arricchimento funzionale (GO/KEGG)
• Visualizzazione dei dati: figure ad alta risoluzione pronte per la pubblicazione (heatmap, volcano plot, grafici personalizzati in ggplot2/ComplexHeatmap)

Strumenti & tecnologie:

Lingue: R (Tidyverse, Bioconductor), Bash/Linux

Tipi di dati: FASTQ, BAM, VCF, matrici di conteggio

Perché lavorare con me:

Metodi basati sulla letteratura attuale e rigorosi dal punto di vista accademico

Codice pulito e riproducibile con report di analisi dettagliati

Comunicazione chiara e tempi di consegna rapidi