Eseguirò analisi rnaseq e bioinformatica sui dati
Biologo PhD in genetica molecolare, endocrinologia e bioinformatica
Informazioni su questo servizio
Offro supporto di bioinformatica per progetti di RNA-seq e transcriptomica, inclusi controllo qualità, trimming delle read, quantificazione dei trascritti, generazione di conteggi genici, assemblaggio de novo del transcriptoma e analisi di espressione differenziale. Creo anche grafici PCA, heatmap, volcano, MA, tabelle di conteggio normalizzate e figure per geni specifici di interesse. Lavoro in ambienti R, Python e Linux e ho esperienza con strumenti come DESeq2, Salmon, tximport, featureCounts e fastp. Ogni progetto è personalizzato in base all'organismo, al disegno sperimentale, ai file di riferimento disponibili e alle domande specifiche che vuoi rispondere.
Linguaggio di programmazione:
Python
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R
Tecnologia:
Excel
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Fogli Google
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Quaderno jupyter
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Altro
Expertise:
Progettazione esperimenti
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Statistiche
•
Altro
Strumenti:
RStudio
•
Microsoft Excel
