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Eseguirò analisi di docking molecolare e di interazione proteina-ligando.
Studente di PhD in Pharmacoinformatics
Sono un ricercatore specializzato in studi su piante medicinali, tassonomia e pharmacoinformatics. Ho vasta esperienza in docking molecolare e simulazioni di dinamica molecolare per la valutazione di ...
Informazioni su questo servizio
Stai cercando un'analisi di docking molecolare affidabile e scientificamente significativa per la tua ricerca?
Offro analisi di docking molecolare e interazioni tra proteina e ligando per ricerche in biologia computazionale, scoperta di farmaci, fitochimica, prodotti naturali e campi correlati.
I miei servizi includono:
Docking molecolare
Preparazione di proteine e ligandi
Docking molecolare usando AutoDock/AutoDock Vina
Analisi dell'affinità di binding
Valutazione delle pose di docking
Analisi delle interazioni
Legami a idrogeno
Interazioni idrofobiche
Interazioni ππ e πalkyl
Interazioni van der Waals
Identificazione di residui interagenti importanti
Risultati & Visualizzazione
Tabelle di punteggio di docking/affinità di binding
Diagrammi di interazione proteina-ligando 2D
Visualizzazioni molecolari 3D
Analisi comparativa di più ligandi
Figure pronte per pubblicazione
Posso anche fornire Lipinski drug-likeness, ADMET, BOILED-Egg, predizione di tossicità, dinamiche molecolari (MD), RMSD/RMSF e analisi MM/PBSA come servizi aggiuntivi.
Ho esperienza di ricerca in scoperta di farmaci computazionale, docking molecolare, simulazioni di dinamica molecolare e analisi dell'energia libera di binding, e mi concentro su risultati chiari e interpretabili scientificamente.
Contattami prima di ordinare
Tecnologia:
MATLAB
Tipo di analisi:
Analisi qualitativa
Expertise:
Progettazione esperimenti
Linguaggio di programmazione:
Python
FAQ
Traduzione automatica.
Di cosa hai bisogno da me per iniziare l'analisi di docking?
Ho bisogno della struttura della proteina (ID/PDB/file), delle strutture dei ligandi (SMILES, SDF, MOL o PDB) e delle informazioni sul sito di binding se disponibili. Se non sei sicuro del sito di binding, contattami prima di ordinare.
Quale software di docking usi?
Utilizzo principalmente AutoDock/AutoDock Vina per il docking molecolare e Discovery Studio, PyMOL e UCSF Chimera per analisi e visualizzazioni di interazioni molecolari.
Riceverò i risultati e le figure del docking?
Sì. A seconda del pacchetto scelto, puoi ricevere risultati di affinità di binding, analisi delle interazioni, diagrammi di interazione 2D, visualizzazioni 3D e tabelle comparative.
Puoi analizzare prodotti naturali o fitocomposti?
Sì. Posso analizzare fitocomposti, prodotti naturali e altri composti di piccole molecole per il docking proteina-ligando e analisi delle interazioni.
