Farò analisi bioinformatica di rna seq singola cellula e dati tcga

Ingegnere bioinformatica con 6 anni nel genomica del cancro e oltre 130 progetti remoti consegnati dal 2023 per laboratori, ospedali e biotech.

Cosa analizzo

- Bulk RNA-seq: QC, espressione differenziale (DESeq2, limma), arricchimento GO/KEGG/GSEA, WGCNA

- Single-cell RNA-seq: clustering con Seurat o scanpy, annotazione, traiettoria, comunicazione tra cellule

- Dati pubblici TCGA/GEO/CCLE: firme prognostiche, Cox e nomogramma, infiltrazione immunitaria

- Proteomica, metilazione del DNA, varianti WES/WGS, 16S e metagenomica, GWAS/PRS, multi-omics

- Modelli di biomarker con machine-learning (LASSO, foresta casuale, XGBoost) con validazione esterna

Cosa ottieni

- Figure pronte per pubblicazione (volcano, heatmap, UMAP, curva KM, forest plot, grafici di arricchimento) in stile rivista coerente

- Tabelle dei risultati e script riproducibili in R/Python

- Un documento con metodi e risultati che puoi incollare in un manoscritto, più assistenza per le domande dei revisori

Come funziona

Inviami il tipo di dati, il layout dei campioni e la domanda. Rispondo entro 24 ore con un scope e un prezzo fisso, consegno puntualmente e mantengo la riservatezza dei tuoi dati (NDA benvenuto).

Le analisi che ho realizzato sono state pubblicate in eLife 2026 e Plant Biotechnology Journal.