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Farò analisi di espressione differenziale e arricchimento con rna seq
Sviluppatore di automazione AI
Aiuto le aziende a risparmiare tempo attraverso automazioni alimentate da AI.
Con competenze in Python e Large Language Models (LLMs), creo strumenti pratici che trasformano il lavoro manuale in flus...
Informazioni su questo servizio
Hai bisogno che i tuoi dati di RNA-seq vengano analizzati ma non hai tempo o competenze bioinformatiche? Eseguirò l'intero pipeline DESeq2 e consegnerò risultati pronti per la pubblicazione senza bisogno di codifica da parte tua.
Ciò che offro:
Analisi di espressione differenziale usando DESeq2 (lo standard di riferimento)
Grafici pronti per la pubblicazione: volcano plot, PCA, heatmap
Analisi di arricchimento GO & KEGG per comprendere il significato biologico dei tuoi geni
Risultati chiari e organizzati con interpretazione
Codice R/Bioconductor riproducibile incluso su richiesta
Tu mi invii la matrice di conteggio grezzo + metadati dei campioni. Io mi occupo di tutto il resto.
Il mio background: Combino conoscenze di biologia con competenze computazionali rigorose. Capisco il disegno sperimentale, le vie biologiche e cosa cercano i revisori in un articolo, non solo come eseguire il codice.
Sia che tu sia uno studente laureando che prepara la tesi, un postdoc che corre per la sottomissione di un articolo, o una biotech che valida un target, posso aiutarti a passare dai dati grezzi all'insight biologico, in fretta.
Guarda il mio portfolio per un esempio reale di analisi (GSE150910, 288 campioni di malattie polmonari).
Domande? Scrivimi prima di ordinare, rispondo in poche ore.
Linguaggio di programmazione:
Python
•
R
Tecnologia:
Excel
•
Quaderno jupyter
•
Altro
Tipo di analisi:
Analisi quantitativa
•
analisi statistica
Strumenti:
RStudio
•
Google Colab
•
Microsoft Excel
•
Altro
FAQ
Traduzione automatica.
Cosa devo fornirti per iniziare?
Una matrice di conteggio grezzo (geni come righe, campioni come colonne) e un file di metadati che mi dica a quale gruppo appartiene ogni campione. Se non sai come ottenerli dai tuoi dati di sequenziamento, scrivimi — ti guiderò passo passo.
Non sono sicuro che i miei dati siano adatti per DESeq2. Puoi controllare?
Assolutamente! Inviami prima i tuoi dati e farò un controllo rapido di qualità prima che tu ordini. Se DESeq2 non è adatto ai tuoi dati, ti consiglierò un metodo migliore.
Lavori anche con dati non umani?
Sì! Posso analizzare dati di RNA-seq da topo, ratto, zebrafish, mosca della frutta, Arabidopsis e la maggior parte degli organismi modello. L’arricchimento GO/KEGG è limitato agli organismi con database di annotazione.
Puoi scrivere la sezione metodi per il mio articolo?
Sì, questa opzione è inclusa nel mio pacchetto Premium. Fornirò un paragrafo dettagliato sui metodi che potrai incollare direttamente nel tuo manoscritto.
Cosa succede se ho bisogno di revisioni dopo la consegna?
Ogni pacchetto include revisioni (1 per Basic, 2 per Standard, 3 per Premium). Revisioni aggiuntive possono essere acquistate come extra.
