Farò analisi di single cell rna seq

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Lucy-Yan
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Hai bisogno di un'analisi di single-cell RNA-seq (scRNA-seq) affidabile e pronta per la pubblicazione? Eseguirò una pipeline completa e riproducibile che va dai conteggi grezzi alle figure pronte per la pubblicazione.


Sono un ricercatore con dottorato, con pubblicazioni peer-reviewed in riviste SCI di Q3-Q4 e esperienza pratica con scRNA-seq di 10x Genomics su campioni umani, topi e piante. Ogni progetto include script R o Python versionati, un paragrafo scritto sui metodi e figure che superano i controlli delle riviste (300+ dpi, testo vettoriale dove possibile).


Cosa consegno, dall'inizio alla fine:

- Controllo qualità: filtraggio di cellule/geni, rilevamento di doppietti, filtraggio mitocondriale/ribosomale, grafici pre/post QC

- Normalizzazione e integrazione: normalizzazione Seurat SCTransform o Scanpy; Harmony, Seurat v5 o Scanorama per più campioni / batch

- Riduzione della dimensionalità e clustering: PCA, UMAP/t-SNE, regolazione della risoluzione con clustree

- Annotazione dei tipi cellulari: basata su marker, più mappatura di riferimento con SingleR, Azimuth o CellTypist; annotazione delle piante tramite PlantPhoneDB o scPlantLLM

- Espressione differenziale: marker di cluster e condizione vs condizione, con volcano / MA / heatmap / dotplot

- Analisi avanzate (Standard & Premium): inferenza di traiettoria

  • Strumento

    • RStudio

  • Tipo di grafico

    • Distribuzione

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Lucy-Yan

Illustrator

  • DaCina
  • Membro daago 2026
  • Tempo di risposta medio1 ora

  • Lingue

    Inglese
Hi, I'm Lucy— an illustrator and the lead of a small creative team in China dedicated to children's picture books. Over the past few years, our team has contributed illustrations to published children's content: picture books and illustrated stories for young readers, working alongside authors and self-publishers from initial character sketches to final print-ready pages. What we do best: • Children's book illustration in a warm, hand-drawn storybook style • Custom character design — humans, animals, fantasy creatures • Cover art, storyboarding, and layout for print and ebook

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