Creerò visualizzazioni di dati R per microbioma e analisi NGS


Informazioni su questo servizio
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Hai difficoltà a trasformare i tuoi dati di microbioma o NGS in figure chiare e pronte per la pubblicazione? Creo visualizzazioni rifinite e pronte per i revisori in R per ricercatori, ecologi e bioinformatici.
Ciò che posso creare:
Grafici di diversità (diversità alfa/beta, ordination PCoA/NMDS)
Grafici a barre di abbondanza relativa e heatmap
Boxplot, PCA e grafici di confronto statistico
Formattazione pulita in stile rivista con la tua palette di colori preferita
Perché lavorare con me:
Solido background in R/ggplot2 combinato con una base professionale di ingegneria del software (oltre 5 anni), quindi ogni script è pulito, riproducibile e riutilizzabile
Comunicazione rapida e chiara durante tutto il progetto
Revisioni incluse, così la figura finale corrisponde esattamente a ciò di cui hai bisogno per il tuo articolo, tesi o rapporto
Non sei sicuro di quale pacchetto si adatti ai tuoi dati? Inviami il tipo di dati (16S, shotgun metagenomics, RNA-seq, ecc.) e cosa vuoi mostrare, e ti consiglierò l'opzione giusta prima di ordinare.
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FAQ
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In quale formato devo inviare i miei dati?
CSV, TSV o Excel sono i formati migliori. Posso anche lavorare direttamente con output comuni di QIIME2, phyloseq, DADA2 o altri pipeline di bioinformatica — basta inviarmi il formato che hai e ti farò sapere se è necessario qualche aggiustamento.
Con quali tipi di dati di microbioma o NGS lavori?
Sequenziamento amplicon 16S rRNA, shotgun metagenomics, RNA-seq e dati di composizione ecologica/comunitaria in generale. Se non sei sicuro che i tuoi dati siano compatibili, scrivimi prima di ordinare e ti confermerò.
Posso richiedere uno schema di colori o uno stile specifico per abbinare il mio articolo/tesi?
Sì. Fammi sapere i tuoi colori preferiti, lo stile della rivista o inviami un esempio di figura, e cercherò di riprodurlo il più possibile.
Riceverò lo script R o solo i file immagine?
Entrambi. Ogni ordine include il grafico ad alta risoluzione più lo script R usato per generarlo, così potrai riprodurre o modificare le figure in seguito.

