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Eseguirò analisi differenziale di rnaseq e transcriptomica
Co-fondatore di The Freelance Bubble LLC
Come co-fondatore di The Freelance Bubble, lavoro con un team multidisciplinare di oltre 23 studiosi con dottorato che fornisce supporto di ricerca e tecnico di alta qualità. Sono un biotecnologo dive...
Livello 2
Ha soddisfatto criteri di prestazioni elevate e ha una comprovata esperienza nel soddisfare le aspettative dei clienti.
Molto reattivo
È noto per le risposte super rapide
Informazioni su questo servizio
Da The Freelance Bubble, offriamo analisi professionali di RNA-seq e transcriptomica per ricercatori, laboratori, team accademici e progetti biotech che cercano risultati affidabili, ripetibili e pronti per la pubblicazione.
Il nostro team multidisciplinare porta competenze in bioinformatica, genomica, biologia molecolare, statistica e ricerca scientifica per supportare i progetti dalla pianificazione dello studio all'interpretazione biologica.
I nostri servizi includono:
- Consulenza e revisione di progetti RNA-seq
- Controllo qualità e preprocessing
- Normalizzazione dei conteggi
- Analisi di espressione genica differenziale
- PCA e clustering dei campioni
- Heatmap e volcano plot
- Annotazione genica
- Analisi di arricchimento GO e pathway
- Interpretazione funzionale dei geni significativi
- Figure e tabelle pronte per la pubblicazione
- Script R/Python e workflow ripetibili
- Revisione dei risultati e supporto alla presentazione
Utilizziamo R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook e strumenti di bioinformatica correlati.
Contattaci prima di ordinare per l'elaborazione di raw FASTQ, allineamento, RNA-seq a singola cellula, grandi coorti o pipeline personalizzate.
Dominio:
Machine Learning
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Altro
Linguaggio di programmazione:
Python
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R
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SQL
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Colab
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Altro
Tecnologia:
Python
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R
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Quaderno jupyter
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Pandas
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RStudio
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Altro
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Che tipi di progetti RNA-seq supporti?
Supportiamo progetti di bulk RNA-seq e transcriptomica che coinvolgono analisi di espressione genica differenziale, analisi di pathway, arricchimento funzionale, clustering, visualizzazione e interpretazione biologica.
Puoi analizzare i file FASTQ raw?
Sì, l'elaborazione di raw FASTQ può essere supportata come workflow personalizzato. Contattaci prima di ordinare, perché l'allineamento, la quantificazione e dataset di grandi dimensioni potrebbero richiedere un scope aggiuntivo.
Quali strumenti usi?
A seconda del progetto, utilizziamo R, Python, RStudio, DESeq2, edgeR, limma, Jupyter Notebook e altri strumenti di bioinformatica appropriati.
Esegui analisi di espressione genica differenziale?
Sì. Possiamo eseguire normalizzazione, test di espressione differenziale, analisi di fold-change, filtraggio di significatività e visualizzazione.
Puoi fornire PCA, heatmap e volcano plot?
Sì. Forniamo visualizzazioni professionali come plot PCA, clustering, heatmap, volcano plot e altre figure rilevanti.
Esegui analisi di pathway e arricchimento?
Sì. L'arricchimento funzionale, Gene Ontology e analisi di pathway possono essere incluse a seconda del pacchetto scelto.
Riceverò il codice sorgente?
Sì. Script/notebook ripetibili in R o Python possono essere forniti in base allo scope del progetto.
Puoi aiutare a interpretare i risultati biologici?
Sì. Possiamo aiutare a interpretare geni significativi, pathway arricchiti, pattern di espressione e la loro rilevanza per la tua domanda di ricerca.
Fornisci anche consulenza oltre all'analisi?
Sì. The Freelance Bubble offre sia consulenza esperta che analisi pratiche di transcriptomica, a seconda del pacchetto scelto.
Devo contattarti prima di ordinare?
Sì, soprattutto per file raw FASTQ, RNA-seq a singola cellula, grandi coorti, transcriptomica de novo, pipeline personalizzate o disegni sperimentali complessi.
