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Eseguirò simulazioni di docking molecolare e dinamiche
Dr. Zainab K.
Level 2
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Informazioni su questo servizio
Traduzione automatica.
Contattaci prima di ordinare per personalizzare il tuo progetto!
Noi di The Freelance Bubble offriamo servizi di docking molecolare e simulazioni MD di livello esperto per supportare i tuoi progetti di scoperta di farmaci. Dallo screening dei ligandi all'analisi della stabilità di binding, forniamo risultati riproducibili e pronti per la pubblicazione.
- Docking Starter: Docking di 1-2 ligandi con proteina target + visualizzazione dell'affinità di binding e delle pose. Analisi ADMET.
- Binding Insight: 5-10 ligandi, analisi delle interazioni, mappatura del sito di binding e punteggi di docking comparativi. Analisi ADMET.
- Dynamic Discovery Suite: Docking completo + simulazioni MD (fino a 100 ns) con grafici di RMSD, RMSF, Rg e stabilità del binding. (Parla con noi se hai bisogno di più tempo di simulazione)
Strumenti e risorse:
- Docking proteina-ligando (AutoDock, PyRx),
- Simulazioni MD (GROMACS/AMBER),
- Analisi delle interazioni e della stabilità (RMSD, RMSF, Rg, SASA),
- Calcolo dell'energia e visualizzazioni (PyMOL, Chimera).
- Analisi ADMET (SwissADME)
Include report dettagliati, grafici e script riproducibili (su richiesta).
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Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble
Level 2
- DaPakistan
- Membro damag 2025
- Tempo di risposta medio1 ora
- Ultima consegna1 settimana
Lingue
Inglese, Urdu, Punjabi
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I lead a team of 23+ PhD scholars dedicated to delivering high-quality academic and research support services, including Systematic Reviews, Meta-Analyses, Molecular Simulations, Bioinformatics, Data Analysis, and Scientific Writing.
Besides TFB, I am Biotechnologist turned Bioinformatician, I specialize in in-silico vaccine design, drug repurposing, and coding pipelines. We also organize workshops and training programs to advance research and computational expertise.
We also help start-ups in brandings and visuals.
Own a clothing brand, NayeeReet.
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Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Quali file di input hai bisogno da me?
Di solito, ho bisogno della struttura della tua proteina (formato PDB) e del/i ligando/i in formato MOL2/SDF/PDBQT. Se non li hai, posso aiutarti a prepararli.
Quale software utilizzi?
Utilizzo AutoDock Vina, PyRx per il docking e GROMACS (o AMBER su richiesta) per le simulazioni MD. Le visualizzazioni sono create con PyMOL, Chimera o VMD.
Puoi eseguire simulazioni per qualsiasi proteina?
Sì, purché sia disponibile una struttura 3D valida (PDB o modello di omologia), posso eseguire docking e simulazioni MD.
Riceverò un rapporto?
Sì. Ogni pacchetto include un rapporto PDF dettagliato con metodi, risultati, grafici (ad esempio RMSD, RMSF) e visualizzazioni del legame. I pacchetti premium includono anche file di input/output e script.
Questi risultati sono adatti per pubblicazioni o tesi?
Assolutamente sì. Seguo workflow di livello ricerca e fornisco visualizzazioni e dati pronti per la pubblicazione.
I miei dati vengono mantenuti riservati?
Sì. I tuoi dati sono completamente confidenziali e non verranno condivisi o riutilizzati in nessun caso.
Recensioni
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Dr. Zainab has been a true professional, very knowledgeable, a pleasure to work with. She is honest and straight forward lady. the quality of her work is outstanding. She offers valuable professional advise to her clients. I am truly satisfy with her work and i would recommend her to my colleagues
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