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Eseguirò simulazioni di docking molecolare e dinamiche
Dr. Zainab K.
Level 2
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Informazioni su questo servizio
Traduzione automatica.
Da The Freelance Bubble, offriamo servizi professionali di molecular docking e simulazioni di dinamica molecolare per la scoperta di farmaci, screening virtuale e studi sull'interazione tra proteine e ligandi. Ci concentriamo su workflow riproducibili, interpretazioni chiare e risultati pronti per la pubblicazione.
I nostri pacchetti includono:
- Docking Starter: Docking di 1-2 ligandi con un target proteico, comprensivo di affinità di binding, visualizzazione della miglior-pose, analisi delle interazioni e valutazione ADMET.
- Binding Insight: Docking di 5-10 ligandi con punteggi comparativi, mappatura del sito di binding, profilo delle interazioni, analisi delle pose e valutazione ADMET.
- Dynamic Discovery Suite: Docking completo più simulazione MD fino a 100 ns, comprensiva di RMSD, RMSF, raggio di gyration, SASA e analisi della stabilità del binding. Simulazioni più lunghe possono essere organizzate tramite un'offerta personalizzata.
Strumenti: AutoDock, PyRx, GROMACS, AMBER, PyMOL, Chimera e SwissADME.
I deliverables possono includere grafici, figure delle interazioni, tabelle dei risultati, report dettagliati e script riproducibili su richiesta.
Contattaci prima di ordinare per personalizzare il tuo progetto.
Scopri di più su Dr. Zainab K.
Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble LLC
Level 2
- DaPakistan
- Membro damag 2025
- Tempo di risposta medio1 ora
- Ultima consegna2 settimane
Lingue
Inglese, Urdu, Punjabi
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I work with a multidisciplinary team of 23+ PhD scholars delivering high-quality research and technical support. I am a biotechnologist turned bioinformatician specializing in in-silico vaccine design, immunoinformatics, drug repurposing, molecular docking, genomics, NGS analysis, and computational pipelines. I also contribute to research workshops and training programs, support startup with branding and visuals, and am involved in entrepreneurship through the clothing brand NayeeReet.
Traduzione automatica.
Il mio portfolio
FAQ
Traduzione automatica.
Quali file di input hai bisogno da me?
Di solito, ho bisogno della struttura della tua proteina (formato PDB) e del/i ligando/i in formato MOL2/SDF/PDBQT. Se non li hai, posso aiutarti a prepararli.
Quale software utilizzi?
Utilizzo AutoDock Vina, PyRx per il docking e GROMACS (o AMBER su richiesta) per le simulazioni MD. Le visualizzazioni sono create con PyMOL, Chimera o VMD.
Puoi eseguire simulazioni per qualsiasi proteina?
Sì, purché sia disponibile una struttura 3D valida (PDB o modello di omologia), posso eseguire docking e simulazioni MD.
Riceverò un rapporto?
Sì. Ogni pacchetto include un rapporto PDF dettagliato con metodi, risultati, grafici (ad esempio RMSD, RMSF) e visualizzazioni del legame. I pacchetti premium includono anche file di input/output e script.
Questi risultati sono adatti per pubblicazioni o tesi?
Assolutamente sì. Seguo workflow di livello ricerca e fornisco visualizzazioni e dati pronti per la pubblicazione.
I miei dati vengono mantenuti riservati?
Sì. I tuoi dati sono completamente confidenziali e non verranno condivisi o riutilizzati in nessun caso.
Recensioni
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F faalsaeed
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Collaborazione in corsoGreat communication, fast responses, and professional work. Very cooperative and reliable. Highly recommended.
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Utile?A audreylee04
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Collaborazione in corsoVery professional! I am happy with the service. :)
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Algeria
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