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Eseguirò analisi differenziale di espressione genica RNA-Seq usando edger o deseq
Analista di bioinformatica e scrittore scientifico per dati RNA Seq e NGS
Sono uno studente di MS in Bioinformatica alla NUST con una laurea in Optometria. Ho esperienza pratica nell'analisi di dati di sequenziamento di nuova generazione (NGS). Le mie competenze includono a...
Informazioni su questo servizio
Stai cercando un'analisi professionale di espressione genica differenziale RNA-Seq?
Eseguirò un'analisi completa di DGE sui tuoi dati di matrice di conteggio usando edgeR o DESeq2 in R.
Ciò che otterrai:
- Controllo qualità (grafico PCA e heatmap)
- Rilevamento e rimozione di outlier
- Normalizzazione TMM
- Analisi di espressione differenziale
- Volcano plot con geni significativi evidenziati
- File CSV con risultati completi
- Sommario dei geni upregolati e downregolati
Ho esperienza pratica nell'analisi di grandi dataset RNA-Seq con centinaia di campioni usando pipeline edgeR e DESeq2 in R.
Contattami prima di ordinare per discutere i tuoi dati e le tue esigenze!
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FAQ
Traduzione automatica.
In quale formato devono essere i miei dati?
Ho bisogno di una matrice di conteggio raw in formato .txt o .csv e di un file di metadati con le informazioni sul gruppo di campioni.
Quale strumento usi edger o deseq2?
Posso usare sia edger che deseq2 a seconda delle tue preferenze. Entrambi forniscono risultati affidabili per l'analisi di espressione genica differenziale RNA-Seq.
Cosa riceverò dopo l'analisi?
Riceverai figure ad alta risoluzione tra cui grafico PCA, heatmap e volcano plot, un file CSV con tutti i risultati e un sommario dei geni differenzialmente espressi.
