Farò analisi e visualizzazione dei dati di transcriptomics con r o python

Fornisco analisi dei dati di transcriptomics, inclusa l'analisi dell'espressione RNA-seq, test statistici, visualizzazione (PCA, heatmap, volcano plot) e modelli di machine learning di base per classificazione e interpretazione biologica usando R o Python.

Analisi di transcriptomics include:

• Elaborazione dei dati RNA-seq (conteggi / matrice di espressione)
• Analisi di espressione differenziale (statistiche di base: t-test, confronti in stile DE se i dati sono forniti)
• Normalizzazione dei dati (scaling di base / trasformazione log)
• Analisi esplorativa:
• Grafici PCA
• Heatmap
• Grafici in stile volcano (se ci sono risultati DE)
• Confronto tra gruppi (controllo vs malattia, ecc.)

Analisi statistica include:

• Media, varianza, fold-change
• Confronti tra gruppi (t-test / test statistici di base)
• Analisi di correlazione
• Interpretazione di base dei risultati

Machine Learning :

• Modelli di classificazione di base:
• Regressione logistica
• Random Forest
• Selezione delle caratteristiche
• Valutazione del modello:
• Precisione, matrice di confusione
• Curva ROC

Tutti i package includono script di codice riproducibili (R/Python) così puoi riprodurre e validare completamente l'analisi

Gli ordini personalizzati sono ben accetti, in base a dataset specifici, requisiti di analisi e obiettivi di ricerca