Analizzerò i risultati di knockout genetico virtuale con sctenifoldknk

Analizzo gli output esistenti di scTenifoldKnk e organizzo i risultati di knockout genetico virtuale attorno al tuo gene bersaglio e al tipo cellulare.

Il pacchetto Base copre un bersaglio e un tipo cellulare usando i file di risposta o di rete esistenti. Verifico gli identificatori, riassumo i risultati di regolazione differenziale e creo grafici chiari e tabelle modificabili. Può essere inclusa una comparazione tra i semi forniti quando si è concordato prima dell’ordine.

Ricevi tabelle di risultati, figure, lo script di analisi e un README che annota input e impostazioni. Una revisione è inclusa per l’analisi concordata.

Inviami per favore il gene bersaglio, le etichette dei tipi cellulari, i file di output esistenti e la domanda a cui vuoi rispondere. Per l’arricchimento, fornisci i geni testati e la lista di geni di sfondo.

Se hai solo un accession GEO o un oggetto Seurat, scrivimi prima: la costruzione della rete e l’elaborazione dei dati grezzi richiedono uno scopo separato. Uso la codifica assistita dall’IA dove è appropriato e controllo codice e output. La comunicazione scritta è ben accetta.