Fornirò analisi completa di rna seq e espressione differenziale
Ricercatore in Bioinformatica
Informazioni su questo servizio
Se lavori con dataset di RNA-seq o Microarray e vuoi estrarre cambiamenti significativi e statisticamente robusti nell'espressione genica, come ricercatore di biologia computazionale specializzato in genomica e trascrittomica, offro analisi rigorose, end-to-end, di espressione differenziale e workflow di biologia dei sistemi su misura per i tuoi obiettivi di ricerca.
Che tu stia investigando meccanismi di malattie, trattamenti farmacologici o perturbazioni genetiche, trasformerò le tue matrici di dati grezzi o processati in figure pronte per pubblicazione e report analitici completi.
Linguaggio di programmazione:
R
Tecnologia:
Altro
Tipo di analisi:
Analisi quantitativa
•
analisi statistica
Strumenti:
RStudio
FAQ
Traduzione automatica.
Quali formati di file sono necessari per iniziare l'analisi?
Per RNA-seq, lavoro tipicamente con matrici di conteggi raw (CSV/TXT) o tabelle di conteggi raw. Per i dati di Microarray, funzionano meglio matrici di espressione normalizzate o file CEL raw. Sentiti libero di scrivermi se non sei sicuro del formato del tuo file.
Quali pacchetti R usi per l'analisi?
Per i dati di RNA-seq, utilizzo pipeline robuste di Bioconductor principalmente basate su DESeq2 (o edgeR su richiesta). Per i dati di Microarray, uso limma. Per l'analisi di rete, utilizzo STRING e Cytoscape.
Le figure saranno adatte per pubblicazioni scientifiche?
Sì! Tutte le visualizzazioni (volcano plot, heatmap, PCA) sono generate in alta risoluzione (300+ DPI, formati PDF/PNG) con etichette chiare, pronte per essere incluse in articoli di ricerca, tesi o presentazioni.
Puoi aiutare a interpretare i risultati biologici?
Certamente. Oltre alle tabelle statistiche e ai risultati raw, fornisco un rapporto riassuntivo chiaro che spiega i risultati, i geni significativi e i risultati di arricchimento di pathway in un contesto biologicamente significativo.
Devo contattarti prima di effettuare un ordine?
Sì, consiglio vivamente di inviare prima un messaggio rapido con i dettagli del progetto e una panoramica del dataset. Questo ci permette di scegliere il pacchetto e l'approccio più adatti alle tue domande di ricerca specifiche.

